أنشئ قسم الكيمياء الصيدليـة منذ بداية كلية الصيدلة بجامعة الأمير سطام بن عبد العزيــز، حيث يعتبــر أحد الأقســام الرئيسيــة بهــا، ومنذ انطــلاق العمـل بالقســم، حرص أعضــاء هيئة التدريس بالقســم على تطويــر مقرراته الدراسـية من خلال استخـــدام طرق التدريس الحديثـة وتحديـث آلياتــه لتتسق كذلك مع متطلبات تخريــج صيادلة على درجة عالية من الكفاءة من الكلية لتلبية إحتياجات سوق العمل، للمساهمة في رؤية المملكة ٢٠٣٠.
يتولى القســم مسؤوليــة تدريــس عدد من المقــررات على مدار العــام الدراسي لتغطي مناهــج الكيمياء الطبية، والكيمياء العضوية والكيمياء التحليلية. إن الهدف الرئيسي لقسم الكيمياء الصيدلية بكلية الصيدلة بجامعة الأمير سطام بن عبد العزيــز هو إعداد صيادلــة مؤهلين لتقديــم الخدمــات الصحية الصيدليــة للمواطـن في جميع القطاعات العامة والخاصة. كما يضم القسم المقررات التالية:
- الكيميــاء الدوائيــة الذي يشمل على عدة مسارات منها مسار دراســة كيف يعمل الدواء داخل الجسم وتاثيرة على الجســم وتأثير الجسم علية والأثار الجانبية المتوقعـة من تلك التأثيرات وكيفية استكشاف الأدويــة ومسار تصميــم الأدويـة وكيفيــة استخدام برامــج التعديـل الجزيئي ثم تشيـدهــا داخـل المعمل ومسـار دراسـة تأثير الأدويــة على الأجهزة المختلفــة واثارها الجانبية الغير مرغوب بها وكيفية العمل على تطويرها او تشييـــد أدويــة جديدة اقل اثارا جانبية وذات فعالية أكبر.
- الكيميـــاء الصيدليــة التحليليــة الذي يشمـل على عدة مسارات منها مســار استحداث الطرق التحليلية للأدوية ومسار تحليل المستحضرات الصيدلانية ومسار دراسة التغييرات الكيميائية للأدوية.
- الكيميــاء العضويــة وتشمـل دراسـة تركيب وخواص وكيفيــة الكشف عن المركبــات العضوية، دراسة الكيمياء الفراغيـة والتفاعـلات الكيميائيـة المختلفــة وماهيتهــا، اضافة الى دراسـة المركبــات العضويــة الغير متجانســــة وتفاعلاتها المختلفة وماهيتها وكيفية استخدامها كنواة فى صناعة الادوية المخلتفة.