يهتم قسم العقاقير بدراسة الأدوية المشتقة من المصادر الطبيعية المختلفة، كالنباتات و غيرها من الأحياء الأخرى، مثل الأحياء الدقيقة و البحرية و كذلك الحيوانات و غيرها. و لذلك يهدف القسم الى تزويد الطلاب بالمهارات اللازمة بدءاً من طرق جمع العقاقير و تجفيفها وتخزينها وفصل مكوناتها و دراسة الكيميائيه والتعرف عليها. بالاضافة الى التشييد الحيوي لها و تطبيقات استخدامها في المستحضرات الصيدلية و رقابة جودتها و دراسة سميتها و تعارضاتها المحتملة مع أدوية أخرى. كما يهدف الى دراسة بعض العقاقير الحيوية و البيولوجية، مثل المضادات الحيوية واللقاحات والأمصال والأنزيمات (الخمائر) والهرمونات والفيتامينات و المعادن. كما يهتم القسم بتزويد الطلاب بالمعرفة اللازمة في مجال المواد المساء استخدامها مثل المخدرات والمنشطات و المستنشقات. و يعتبر قسم العقاقير ركيزة أساسية لدراسة المكملات الغذائية و المستحضرات الصيدلية الحيوية و العلاج بالأعشاب.
