أنشأ قسم الكيمياء الصيدلية منذ بداية كلية الصيدلة بجامعة الأمير سطام بن عبد العزيز، حيث يعتبر أحد الأقسام الرئيسية بها، ومنذ انطلاق العمل بالقسم، حرص أعضاء هيئة التدريس بالقسم على تطوير مقرراته الدراسية من خلال استخدام طرق التدريس الحديثة وتحديث آلياته لتتسق كذلك مع متطلبات تخريج صيادلة على درجة عالية من الكفاءة من الكلية لتلبية إحتياجات سوق العمل للمساهمة في رؤية المملكة 2030.
يتولى القسم مسؤولية تدريس عدد من المقررات على مدار العام الدراسي لتغطي مناهج الكيمياء الطبية، والكيمياء العضوية والكيمياء التحليلية،.
ان الهدف الرئيسي لقسم الكيمياء الصيدلية بكلية الصيدلة بجامعة الأمير سطام بن عبد العزيز هو إعداد صيادلة مؤهلين لتقديم الخدمات الصحية الصيدلية للمواطن في جميع القطاعات العامة والخاصة. كما يضم القسم أربع مقررات وهي:
- الكيمياء الدوائية الذي يشمل على عدة مسارات منها مسار دراسة كيف يعمل الدواء داخل الجسم وتاثيرة على الجسم وتأثير الجسم علية والأثار الجانبية المتوقعة من تلك التأثيرات وكيفية استكشاف الأدوية ومسار تصميم الأدوية وكيفية استخدام برامج التعديل الجزيئي ثم تشيدها داخل المعمل ومسار دراسة تأثير الأدوية على الأجهزة المختلفة واثارها الجانبية الغير مرغوب بها وكيفية العمل على تطويرها او تشييد أدوية جديدة اقل اثارا جانبية وذات فعالية أكبر.
- الكيمياء الصيدلية التحليلية الذي يشمل على عدة مسارات منها مسار استحداث الطرق التحليلية للأدوية ومسار تحليل المستحضرات الصيدلانية ومسار دراسة التغييرات الكيميائية للأدوية.
- الكيمياء العضوية وتشمل دراسة تركيب وخواص وكيفية الكشف عن المركبات العضوية، دراسة الكيمياء الفراغية والتفاعلات الكيميائية المختلفة وماهيتها, اضافة الى دراسة المركبات العضوية الغير متجانسة وتفاعلاتها المختلفة وماهيتها وكيفية استخدامها كنواة فى صناعة الادوية المخلتفة.